MINISSATÉLITES

Os minissatélites ou locos VNTR ('Variable Number of Tandem Repeats') são regiões dispersas no genoma que contém um número variável de seqüências repetidas e enfileiradas (tandem) de DNA que têm um núcleo comum de 10 a 15 pares de bases (Jeffreys et al., 1985). Podem ser analisados tanto através de RFLPs ou PCR. Muitos dos minissatélites são altamente polimórficos, produzindo um grande número de bandas. Por estarem espalhadas por todo o genoma e apresentarem um número variável de repetições em diferentes indivíduos em relação a uma mesma região cromossômica (loco), os minissatélites simultaneamente proporcionam um conjunto de marcadores genéticos que se constitui no que tem sido denominado de impressões digitais de DNA, consequentemente, indivíduo-específicos.  Para a obtenção do padrão de bandas utiliza-se o mesmo procedimento utilizado para o RFLP, com exceção de que a sonda contendo repetições de sequência conhecida.

Em uma pesquisa foi possível analisar as sequências de DNA depositadas no banco de dados para o desenho de um grande número de locos de minissatélites para a cultura do mamoeiro, a exemplo de microssatélites. O objetivo deste trabalho foi a identificação e o desenvolvimento de minissatélites para a cultura do mamoeiro por meio de mineração na base de dados de DNA. Utilizaram-se dois genótipos de mamoeiro (Calimosa e Sunrise Solo).

Foram obtidas 48723 sequências relacionadas à pesquisa “ Carica papaya ” no NCBI
em outubro de 2009. Deste total, foram encontrados 123 sequências contendo
minissatélites, das quais, foi possível desenhar 49 primers minissatélites, com repetições de
7 a 18 nucleotídeos. Quarenta e cinco sequências (91,8%) são perfeitas, duas (4,1%)
compostas-perfeitas e duas (4,1%) interrompidas. Dentre esses locos, 20 foram sintetizados,
com variação no tamanho esperado de alelos de 284 a 979 pares de bases.
As concentrações dos reagentes para a PCR propiciaram adequada amplificação do
DNA alvo (Figura 1). Doze iniciadores (60%) foram otimizados com a temperatura de
anelamento de 60°C, os outros otimizaram à 58°C (10 %), 61°C (10%), 62°C (10%) e 63°C
(10%) (Tabela 1). A análise preliminar com apenas dois genótipos indica que 14 marcadores
(70%) são monomórficos e os outros seis (30%) são polimórficos. Entretanto, a próxima
etapa do trabalho será a avaliação do polimorfismo dos 20 locos num conjunto de
germoplasma do BAG-Mamão da Embrapa-CNPMF.

Como conclusão tiveram vinte locos de minissatélites que foram desenvolvidos e otimizados para a cultura do mamoeiro. Este tipo de marcador trará grandes contribuições para a detecção de
polimorfismos de forma rápida e prática na cultura do mamoeiro.

Descoberto em 1984 por Alec Jeffreys.

Fontes: http://pt.wikipedia.org/wiki/Microssat%C3%A9lite_(gen%C3%A9tica)
ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/.../1/ID27130pdf915.pdf‎